成像指南¶
显微镜配置¶
要成功对 PRISM/SPRINTseq 文库进行成像，您的显微镜需要以下规格：
- 物镜: 20x 或 40x (根据分辨率需求选择干镜或油镜)。推荐高数值孔径 (NA > 0.75)。
- 通道: DAPI, FITC (488), Cy3 (550), Cy5 (647), Cy7 (750)。
- 相机: 大视场推荐使用 sCMOS。
图像采集¶
- 聚焦: 在 DAPI 通道上自动聚焦。
- 曝光: 调整曝光，使信号占动态范围的 ~20-50%。避免过饱和。
- Z-Stacks: 对于薄组织 (10 µm)，通常 1 µm 步进的 3-5 层切片就足够了。
数据存储¶
- 保存为 16-bit TIFF。
- 命名约定:
Experiment_Sample_Region_Channel.tif